1、冷冻疗法
利用-196℃低温的液体氮，采用压冻法治疗尖锐湿疣，促进疣组织坏死脱落。本法适用于数量少，面积小的湿疣。可行1～2次治疗，间隔时间为一周。
2、激光治疗
通常用CO2激光，采用烧灼法治疗尖锐湿疣，本疗法最适用于阴茎或肛周的湿疣。对单发或少量多发湿疣可行一次性治疗，对多发或面积大的湿疣可行2～3次治疗，间隔时间一般为一周。
3、电灼治疗
采用高频电针或电刀切除湿疣。本疗法适用于数量少，面积小的湿疣。原理是使用安全适度的电流去掉病变组织，再以火花放电灼除残存病损，操作时需要注意不要损伤到其他正常组织。
4、微波治疗
采用微波手术治疗，利多卡因局麻，将杆状辐射探头尖端插入尖锐湿疣直达疣体基底，当看到疣体变小、颜色变暗、由软变硬时，则热辐射凝固完成，即可抽出探头。凝固的病灶可以用镊子夹除。为防止复发，可对残存的基底部重复凝固一次。
5、药物疗法
杀病毒药物目前主要是以大环三萜类为主，其主要治疗的原理为，大环三萜可杀死潜藏在皮肤黏膜中的HPV病毒。此类药物治疗的疗程长，疣体脱落比较慢，但复发率很低。
6、中医治疗
疗法一湿疣外洗方虎杖30g，龙胆草30g，大黄30g，赤芍20g，石榴皮30g，枯矾20g，莪术30g，紫草30g，水煎成2000ml微湿擦洗疣体15-20分钟，每天2次。
疗法二水晶膏石灰水、糯米各适量。将糯米放于石灰水中浸泡24-36小时，取糯米捣烂成膏备用，使用时将膏直接涂在疣体上，每天1次，直至疣体脱落。
疗法三灸法局麻后，将艾炷放在疣体上点燃任其烧尽，视疣体大小每次1-3炷，每天1次，至疣体脱落。