手术切除是常见的治疗方法之一，而对于尖锐湿疣通常并不主张手术切除，因为手术治疗后，尖锐湿疣很容易复发，使治疗失败。但对带蒂的较大的疣体可考虑先做手术切除，先控制住局部病变，再继续治疗。

优点：操作繁琐，适宜单个孤立的、巨大的疣体。

缺点：不能够去除HPV病毒，只能去除疣体，伤口容易感染HPV病毒复发，复发率高。另外，特殊部位不能够使用此方法。

因此，一旦治疗方法选择不当，就会导致尖锐湿疣得不到彻底根治。在临床治疗中，有很多尖锐湿疣患者就是因为这个原因，使得病情反复发作、久治不愈。更严重的是，部分尖锐湿疣患者还会诱发阴茎癌、宫颈癌，丧失了宝贵的生命。

南京优嘉病毒疣医学研究所采用“2011101665723”号发明专利中医组方(国家知识产权局可以查询的)，针对各种尖锐湿疣病变，包括腔道内(如：口腔、尿道、宫颈、肛内等)治愈率很高。中医药标本兼治是祖国医学的根本，也是西医西药无法比拟的。