病学资料表明，尖锐湿疣与生殖器癌之间有着密切的关联。有报告指出，百分之五到百分之十的外阴、宫颈和肛周的尖锐湿疣经过一段时期后可出现间变和发展为原位癌或浸润癌。还发现百分之十五阴茎癌、百分之五女性外阴癌是在原尖锐湿疣的基础上发生的，特别是宫颈癌，发生恶变者尤其与HPV-16、18、31、33型有关。巨大尖锐湿疣可继发癌变。

有报告统计，百分之四点七到百分之十点二的尖锐湿疣可发展成宫颈癌。还有学者指出，百分之十五阴茎癌的发生来自尖锐湿疣，百分之五女性外阴癌及百分之五肛门癌继发于尖锐湿疣，孕妇如被感染，病毒可在分娩过程中传染给婴儿，引起婴儿的喉部乳头状瘤。许多实验室研究也进一步表明，HPV、尖锐湿疣和生殖器癌三者之间存在着因果关系。外阴、阴茎或肛周的尖锐湿疣可以转化为鳞状细胞癌。

尖锐湿疣的治疗难度大，一般的疗法若是不能清除患者体内的深层病毒，那么疾病就很容易复发。而且，疾病长久复发下去，不仅会使得病情越来越重，诱发癌症的机会也越来越大。因此，患者一定要尽快到正规医院进行治疗，才能最大程度上避免癌变。

随着我国医学工作者对性病诊疗经验的不断积累，已经有针对尖锐湿疣的发明专利中医组方（专利号：2011101665723），泡洗加内服，无需手术，根据个体发病情况合理用药、调配组方。只要患者本身没有同时患有免疫系统疾病，都可以通过该组方得到彻底地治愈。